• 鶯歌林摶秋父子農具標本捐贈本館 (館訊263期第四版, 2009.10)
  此批農具為臺灣五○到六○年代農家所使用的器具，包括牛犁、秧毗、釘耙、鐵耙、手鍬、大拖、鎚子等，約七十多件的蒐藏。見證了臺灣從農業走上工業化的歷史，呈現臺灣早期生計的樣貌，為年輕一代訴說歷史，也讓老一輩重溫兒時的回憶。
  本館的農業生態展示區，展出臺灣古早的農業生計，這批藏品除了可透過展品輪換的方式，和觀眾見面，也可透過自然學友之家，或是相關的展示與教育活動與觀眾互動。
• 廖健翔先生捐贈新種臺灣小孔蛸 (館訊258期第一版, 2009.5)
  中山大學海生所碩士班畢業的廖健翔先生深入調查、研究臺灣附近海域所產的小孔蛸，發現屬於新種的臺灣小孔蛸 Cistopus taiwanicus n. sp.，也廣泛分布在亞洲大陸沿岸到印度海域。廖先生在新種發表文章被接受後，將研究用的標本一批，包括全模式標本(Holotype) 及 2件副模式標本(Paratype) 在內的11件標本，捐贈本館典藏。新種發表文章將刊登在 Journal of Molluscan Studies。

2006~2008年 研究成果 (新聞發佈)

• 2008.03.18 人類學家最新發現台中惠來人母系血緣可能來自亞洲北部*
  根據科博館、上海復旦大學與花蓮慈濟大學共同進行的古代DNA實驗結果顯示，惠來人的母系血緣可能來自亞洲北部，而從鹿寮遺址玻璃珠的成分分析，更發現其製作技術與當時台灣和中國大陸及東南亞的貿易往來有密切關連。這些研究發現，將有助於解開過去台灣先住民的起源與遷移之謎。
• 2007.07.19 「重傘靈芝」研究獲證實--科博館為台灣野生赤芝正名
  科博館和國立台灣博物館共同發表這項研究歷程及發現成果，為長久以來與中、日、韓的赤芝套用相同學名的台灣本土赤芝正名。
• 2007.06.28 顧世紅博士--與蠶共舞20年研究成果再度登上國際知名學術期刊(SCI)「昆蟲生理學雜誌」
  顧世紅博士近二十年時光與蠶共舞，以抽絲剝繭的科學精神探究其生長奧秘，在世界知名學術期刊上屢次發表研究成果，並獲得國際昆蟲學界肯定與及許多本教科書引用。
• 2007.03.09 鹿港知名攝影家許蒼澤先生攝影作品捐贈科博館
  本館獲得鹿港攝影名家許蒼澤先生家人捐贈約25萬張攝影作品底片、出版品及相關手稿文獻。
• 2007.03.02 地質學典藏菁華記者發表會
  距今億萬年前古鱷類化石群首度曝光，近距離欣賞來自外太空的隕石，以及深藏地底的美鑽、寶石等珍稀礦石，為您解讀來自宇宙與地心的時空密碼，並揭開傳說中「夜明珠」的神祕面紗。
• 2006.12.13 台南縣政府捐贈三件黑面琵鷺標本，與「史溫侯巡迴展」同步展出
  95年8月間林宗賢館長親自南下拜訪蘇煥智縣長洽談黑面琵鷺標本捐贈事宜，獲得蘇縣長慨然允諾。標本適時運抵科博館，並與「史溫侯巡迴展」同步展出，不但讓觀眾看到150年前英國博物學家史溫侯對台灣特有生物研究的深刻軌跡，也見證今日台灣在生態保育工作上的努力成果，意義非凡。
• 2006.10.01 黃文山博士--蘭嶼長尾南蜥親代照顧最新研究登上世界著名動物行為學期刊 (Animal Behaviour)
  黃文山博士歷經十年完成蘭嶼本土種蜥蝪---長尾南蜥親代照顧之研究成果，10月1日登上了世界知名的動物行為學期刊(Animal Behaviour)，享譽國際的兩棲爬蟲類專家Dr. Rick Shine 審閱論文後並給予極佳的評價，表示這項研究成果「對該領域的研究有跳躍性的極大貢獻」。這項研究也是國立自然科學博物館對台灣本土生物研究的重要里程碑。