瀛海探奇探討的是海洋世界的面貌，從潮汐的漲落到海岸的侵蝕、從大西洋擴張到盤古大陸的分合、從珊瑚礁到深海生物。在這個主題共分為海洋生物、海洋物理及海洋地質三間教室。

1. 海洋生物教室：
   介紹水中各種不同的生命形式如何巧妙地適應環境；透過奧妙的生存智慧，與周遭環境達成變動的和諧。
   目前課程：水深火熱的綠洲
   [ 課程介紹]
   　
2. 海洋物理教室：
   觀察海岸地形如何受到影響，進而探討海水的來源、以及潮汐、洋流、波浪等作用。
   目前課程：洋流NEW！！
   　
3. 海洋地質教室：
   介紹海洋盆地的形貌、海洋地殼的變動以及海洋中的沈積現象 。
   目前課程：海洋地殼的外形及其成因